يرتكز العلاج بالمخططات المعرفية على مفهوم الاحتياجات النفسية غير المشبعة في الطفولة والصدمات المبكرة؛ والتي تعد البذرة والنواة الأولى في نشأة أشكال المعاناة النفسية، والتي بناءً عليها يقوم الشخص بتبني وتكوين مخططاته المعرفية غير التكيفية وما يعتمد عليه بعد ذلك من أساليب تأقلم غير صحية. ويصبح الهدف النهائي للعلاج بالمخططات تهدئة الجهاز العصبي وإشعاره بالأمان، والتعافي من الهوية الصدمية، والاقتراب من الهوية الحقيقية للشخص، والتدريب على تبني وممارسة أساليب إشباع الاحتياجات النفسية بالشكل الناضج الصحي.